Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms