Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms