Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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GABRA6Q16445 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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GABRA6Q16445 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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GABRA6Q16445 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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GABRA6Q16445 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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