Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA6Q15825 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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