Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SEC23BQ15437 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SEC23BQ15437 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEC23BQ15437 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SEC23BQ15437 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SEC23BQ15437 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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