Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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