Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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