Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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NCF4Q15080 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NCF4Q15080 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NCF4Q15080 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NCF4Q15080 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NCF4Q15080 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NCF4Q15080 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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NCF4Q15080 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCF4Q15080 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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