Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms