Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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