Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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