Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms