Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ITGA9Q13797 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA9Q13797 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms