Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APOFQ13790 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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