Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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