Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ATRQ13535 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ATRQ13535 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ATRQ13535 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ATRQ13535 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ATRQ13535 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
ATRQ13535 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms