Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP3B2Q13367 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms