Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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RPA4Q13156 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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RPA4Q13156 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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RPA4Q13156 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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RPA4Q13156 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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RPA4Q13156 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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RPA4Q13156 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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RPA4Q13156 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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