Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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