Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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