Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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