Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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RAB40BQ12829 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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RAB40BQ12829 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB40BQ12829 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB40BQ12829 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB40BQ12829 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB40BQ12829 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB40BQ12829 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB40BQ12829 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB40BQ12829 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB40BQ12829 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAB40BQ12829 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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