Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXO1Q12778 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXO1Q12778 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXO1Q12778 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXO1Q12778 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXO1Q12778 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXO1Q12778 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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FOXO1Q12778 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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FOXO1Q12778 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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