Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA3Q08378 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms