Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
POLEQ07864 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
POLEQ07864 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
POLEQ07864 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms