Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP1-1Q07627 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms