Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABPB1Q06547 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms