Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms