Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms