Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV1Q03135 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms