Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms