Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms