Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms