Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBB4BP68371 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms