Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UFM1P61960 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UFM1P61960 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UFM1P61960 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms