Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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