Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC13P55735 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC13P55735 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC13P55735 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC13P55735 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC13P55735 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC13P55735 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC13P55735 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC13P55735 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC13P55735 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC13P55735 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms