Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAD23AP54725 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms