Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERFP50548 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERFP50548 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms