Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP4P49662 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP4P49662 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP4P49662 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP4P49662 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP4P49662 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP4P49662 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms