Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX1P48742 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms