Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRB2P47870 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms