Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMPOP42166 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMPOP42166 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPOP42166 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms