Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA4P35212 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA4P35212 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA4P35212 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA4P35212 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA4P35212 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms