Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCKBRP32239 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCKBRP32239 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms