Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms