Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms