Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms