Protein–RNA interactions for Protein: P22105

TNXB, Tenascin-X, humanhuman

Predictions only

Length 4,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXBP22105 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TNXBP22105 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNXBP22105 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms