Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDSP20132 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDSP20132 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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SDSP20132 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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SDSP20132 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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SDSP20132 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDSP20132 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDSP20132 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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